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Table 2 Ten examples of valid missing is-a relations

From: Identification of missing hierarchical relations in the vaccine ontology using acquired term pairs

Missing is-a Relations (Unlinked concept-pair)

ATP

Linked concept-pair

inactivated acellular pertussis vaccine (VO:0003196)

{acellular, pertussis},{}

Acellular Pertussis Vaccine (VO:0003389)

inactivated vaccine (VO:0000315)

 

vaccine (VO:0000001)

Gardasil 9 prefilled syringe (VO:0015038)

{syringe, prefilled},{injectable, product}

Hepatitis B Surface Antigen Vaccine Prefilled Syringe (VO:0003419)

Gardasil 9 Injectable Product (VO:0015039)

 

Hepatitis B Surface Antigen Vaccine Injectable Product (VO:0003415)

inactivated avian influenza vaccine (VO:0001024)

{avian, influenza},{viral}

avian influenza vaccine (VO:0000461)

inactivated viral vaccine (VO:0000712)

 

viral vaccine (VO:0000609)

COVID-19 recombinant vector vaccine (VO:0005199)

{covid-19},{viral}

COVID-19 vaccine (VO:0004908)

recombinant viral vector vaccine (VO:0005331)

 

viral vaccine (VO:0000609)

Hepatitis A Vaccine, Inactivated (VO:0003464)

{hepatitis, a},{}

Hepatitis A virus protein (VO:0010780)

inactivated vaccine (VO:0000315)

 

virus protein (VO:0010754)

Acellular Pertussis Vaccine (VO:0003389)

{pertussis},{}

Bordetella pertussis (NCBITaxon:520)

acellular vaccine (VO:0000756)

 

Bordetella (NCBITaxon:517)

COVID-19 RNA vaccine (VO:0005198)

{covid-19},{}

COVID-19 vaccine (VO:0004908)

RNA vaccine (VO:0000186)

 

vaccine (VO:0000001)

acellular pertussis vaccine, inactivated (VO:0003390)

{inactivated, acellular, pertussis},{bordetella}

inactivated acellular pertussis vaccine (VO:0003196)

Bordetella vaccine (VO:0000587)

 

Bordetella vaccine (VO:0000587)

Human papillomavirus protein (VO:0010786)

{papillomavirus},{}

Papillomavirus vaccine (VO:0000748)

human protein (VO:0000516)

 

vaccine (VO:0000001)

licensed influenza vaccine (VO:0003143)

{influenza},{}

Influenza virus protein (VO:0010782)

licensed vaccine (VO:0000363)

 

virus protein (VO:0010754)